رهبر جمهوری اسلامی در پیام تسلیتی که روز سه‌شنبه به مناسبت درگذشت آیت‌الله شاهرودی منتشر شد او را «کارگزاری باوفا در مهم‌ترین تشکیلات نظام جمهوری اسلامی» توصیف کرد.
آیت‌الله علی خامنه‌ای رئیس فقید مجمع تشخیص مصلحت را «استادی بزرگ در حوزه علمیه قم و کارگزاری باوفا در مهم‌ترین تشکیلات نظام جمهوری اسلامی، عضو مؤثری در شورای نگهبان و رئیس موفّقی در مجمع تشخیص مصلحت» توصیف می‌کند.
او همچنین در پیام خود به «حدود یک سال بیماری سخت و دردناک» آیت‌الله شاهرودی اشاره کرده و درگذشت او را «ضایعه‌ای اسفبار» می‌خواند.
محمود هاشمی شاهرودی، رئیس مجمع تشخیص مصلحت نظام ایران، به دنبال یک دوره طولانی بیماری سرطان شامگاه دوشنبه، سوم دی‌ماه ۹۷، در بیمارستان درگذشت.