وزارت امور خارجه افغانستان روز چهارشنبه، ۲۴ اردیبهشت، از توافق کابل و تهران برای اعزام کمیساریای مرزی به مرز دو کشور برای تحقیقات محلی در مورد حادثه غرق مهاجران افغان خبر داد.
به گفته رسانه‌ها و شماری از مقام‌های افغانستان، یک گروه دست‌کم ۵۰ نفره که عمدتاً از ساکنان ولایت هرات بودند از طریق گذرگاه مرزی «دهانه ذوالفقار» وارد ایران شده بودند اما در نیمه‌شب یازدهم به دوازدهم اردیبهشت با ارعاب مرزبانان به داخل هریرود پریدند و بسیاری از آنها جان باخته‌اند.
گزارش‌هایی از شکنجه برخی از این قربانیان پیش از آن که مجبور به انداختن خود به آب شوند نیز منتشر شده است.
وزارت امور خارجه افغانستان روز چهارشنبه در این باره نوشت که «تحقیقات مزبور مبنی بر قرارداد کمیساران سرحدی بین ایران و افغانستان منعقده سال ۱۳۳۵ هجری شمسی، فردا آغاز خواهد گردید.»
بیانیه این وزارتخانه تأکید کرده است که «حکومت افغانستان این حادثه را الی تأمین عدالت با تمام قوت بررسی خواهد نمود.»
وزارت امور خارجه جمهوری اسلامی همچنان ادعای غرق کردن عمدی مسافران افغان در رودخانه به دست مرزبانان ایرانی را تکذیب می‌کند.
اما محمدحمید طهماسی، رئیس هیئت حقیقت‌یاب افغانستان می‌گوید بر اساس یافته‌های اولیه، ۱۰ نفر در این حادثه کشته شده‌اند و ۱۵ نفر هنوز ناپدید هستند.
نیروی انتظامی جمهوری اسلامی حتی وقوع چنین چیزی در مرزهای مشترک دو کشور را نیز رد کرده بود.