محمد خاتمی، رئیس جمهوری پیشین ایران، در پیامی عدم شرکت بالای پنجاه درصد از واجدین شرایط در انتخابات ریاست‌جمهوری ایران را «بی‌سابقه» خواند و گفت که این امر و «وجود بالاترین درصد رأی‌های باطله» در این انتخابات، «نشانه دلسردی و نومیدی مردم و فاصله آنان با حکومت» است.
آقای خاتمی در پیامی که روز دوشنبه، ۳۱ خرداد منتشر کرده، ضمن تبریک به ابراهیم رئیسی به عنوان «رئیس جمهور منتخب»، پایین بودن سطح مشارکت شهروندان در انتخابات ۲۸ خرداد را «زنگ خطر» برای حکومت عنوان کرده است.
بر اساس قانون انتخابات ریاست‌جمهوری ایران، آرای باطله ازجمله شامل رأی‌هایی می‌شود که روی برگه چیزی به‌جز اسم یکی از نامزدها نوشته شده باشد و نیز رأی‌هایی که سفید به صندوق ریخته شده باشند
در حالی که بنابر گزارش‌های رسمی جمهوری اسلامی، آرای باطله در انتخابات ریاست‌جمهوری ۱۴۰۰ پس از آرای ابراهیم رئیسی در کل ایران رتبه دوم داشته است، آمار استان‌هایی مثل البرز نشان می‌دهد که میزان آرای باطله در آن‌ها در رتبه نخست قرار گرفته و حتی از جمع آرای کل نامزدها هم بیشتر بوده است.
رئیس جمهوری پیشین ایران هم‌چنین با اشاره به «فضای متفاوت مشارکت و رقابت» در انتخابات اخیر گفته است: «آن‌چه در این انتخابات و انتخابات پیش حاصل شد آیا نشان نمی‌دهد که اعتبار اصلاح‌طلبان (نه اصلاح‌طلبی) در جامعه کاهش یافته است؟»
بیشتر در این باره: آرای باطله در کل کشور دوم شد، در برخی شهرها اولآقای خاتمی پیشتر نیز در ششم خرداد در پی رد صلاحیت چهره‌های سرشناسی چون علی لاریجانی، رئیس پیشین مجلس و اسحاق جهانگیری، معاون اول حسن روحانی از سوی شورای نگهبان گفته بود که «جمهوریت» نظام «روز به روز، کمرنگ‌تر» شده و «مورد تهدید جدی‌تر» قرار گرفته است.
او به همه جریان‌های سیاسی با هر «وابستگی و رویکردی» هشدار داده بود که در برابر این «زنگ خطر بزرگ» بی‌تفاوت نباشند.
آقای خاتمی چند روز پیش از برگزاری انتخابات در یک پیام ویدیویی از مردم خواسته بود «تا با حضورشان صحنه را به نفع جمهوریت بهم بزنند.»
رئیس جمهوری پیشین ایران هم‌چنین گفته بود که «مردم به صحنه بیایند تا آن طرحی که می‌خواهد یک جریانی به هر قیمتی ولو با کنار زدن مردم و تهدید کردن رأی و آزادی مردم، فلان شخص و یا فلان جریان را روی کار بیاورد و تحمیل کند، مقابله شود.»
ابراهیم رئیسی در کم‌رونق‌ترین انتخابات ریاست جمهوری ایران با کسب ۱۷ میلیون و ۹۲۶ هزار و ۳۴۵ رای به پیروزی رسید.
این آمار در حالی اعلام می‌شود که هیچ نهاد مستقلی در ایران اجازه بررسی میزان مشارکت و نحوه برگزاری انتخابات را ندارد و مراجع حقوقی و سیاسی مختلف، روند انتخابات ایران را غیر شفاف می‌دانند.
مراجع مستقل، از جمله موسسه گمان در هلند پیش از این میزان مشارکت را بسیار پایین‌تر از ارقام اعلام‌شده و زیر ۳۰ درصد تخمین زده بودند.
رادیو فردا در روز انتخابات ده‌ها ویدیو از کاربران در شهرهای مختلف دریافت کرده بود که حوزه‌های خلوت و عموما خالی از رای‌دهندگان را به تصویر می‌کشد.