در پی متهم شدن اعضای هیئت مدیره کنگره ایرانیان کانادا به «مشروعیت‌بخشی به نظام جمهوری اسلامی» که به ویژه از سوی برخی از اعضای خانواده‌های قربانیان هواپیمای اوکراینی مطرح شده، این هیئت مدیره اتهام‌ها علیه خود را «سیاسی» و «بی‌پایه» خواند.
هیئت مدیره کنگره ایرانیان کانادا با انتشار بیانیه‌ای «ضمن رد تمامی موارد مطرح شده»، نوشت: «طی دوسال گذشته، گروهی با انگیزه‌های سیاسی از طریق انتشار انواع اتهامات و اخبار بی‌اساس در حال گمراه کردن اعضای جامعه نسبت به این نهاد بوده‌اند.»
این هیئت مدیره اضافه کرده: «عملکرد کنگره در راستای خدمت به جامعه ایرانی کانادایی در سال‌های اخیر، از جمله فعالیت‌هایش در حمایت از دادخواهی خانواده‌های قربانیان پرواز اوکراینی، بیش از هر چیزی گویای رویکرد هیئت مدیره کنگره است، نه فرضیات و ادعاهای بی‌پایه.»
پیشتر ده‌ها شهروند ایرانی کانادا در بیانیه‌ای رسمی، اعضای هیئت مدیره کنگره ایرانیان کانادا را به «دفاع از مشروعیت‌بخشی به نظام جمهوری اسلامی» متهم کرده و خواستار استعفای فوری آنها شدند.
این بیانیه که به امضای عده‌ای قابل توجه از خانواده‌های جان‌باختگان پرواز پی‌اس ۷۵۲ از جمله حامد اسماعیلیون و فعالان و کارآفرینان مقیم کانادا رسید، روز چهارشنبه ۹ فروردین منتشر شد.
هشتم دی سال ۱۳۹۸، یک هواپیمای متعلق به اوکراین با ۱۷۶ تن سرنشین از جمله ۵۵ شهروند دوتابعیتی ایرانی- کانادایی، کمی پس از برخاستن از فرودگاه تهران هدف موشک‌های سپاه پاسداران قرار گرفت و همه سرنشینان آن جان باختند.
مقام‌های جمهوری اسلامی در ابتدا در تلاش برای پنهان کردن این فاجعه بودند، اما سپاه پاسداران پس از سه روز «اشتباه بزرگ» خود را تأیید کرد، اما هنوز عوامل این جنایت به دست عدالت سپرده نشده‌اند.
جواد سلیمانی از اعضای خانواده‌های قربانیان هواپیمای اوکراینی، در واکنش به بیانیه هیئت مدیره کنگره ایرانیان کانادا نوشت: «انتخابات و مجمع عمومی سالیانه کنگره ایرانیان کانادا با هیئت مدیره فعلی مشروعیت ندارد.»
آقای سلیمانی این هیئت مدیره را «لابیگران جمهوری اسلامی و سپاه» خواند و افزود: «قطعا گام‌های بعدی در پیش است.»
اما هیئت مدیره کنگره ایرانیان کانادا، درخواست برای استعفای فوری اعضای این هیئت را «تعیین تکلیف دستوری» توصیف کرده است.
هیئت مدیره کنگره ایرانیان کانادا در بیانیه خود نوشت: «اکثریت اعضای هیئت مدیره کنونی کنگره ایرانیان کانادا در انتخاباتی که آزادترین، دموکراتیک‌ترین و گران‌ترین انتخابات یک نهاد اجتماعی در جامعه ایرانی کانادایی بود و تحت نظارت قاضی بی طرف کانادایی برگزار می‌شد، انتخاب شده‌اند».
همچنین بر اساس این بیانیه، «اکنون نیز جمعی از اعضای کنگره ایرانیان کانادا برای عضویت در هیئت مدیره این نهاد داوطلب شده‌اند و روند انتخابات این سازمان مطابق اساسنامه و قوانین، به دموکراتیک‌ترین روش و بر طبق روند سالیان گذشته برگزار خواهد شد.»
بیشتر در این باره: ده‌ها ایرانیِ کانادا خواستار استعفای فوری هیئت مدیره کنگره ایرانیان کانادا شدندبر اساس وب‌سایت کنگره ایرانیان کانادا، این کنگره سازمانی «غیرانتفاعی و غیرحزبی و غیرمذهبی» است که در سال ۲۰۰۷ با هدف حمایت از منافع ایرانیان کانادا تأسیس شده است.
با این حال به گفته امضاکنندگان بیانیه اعتراضی معتقدند این هیئت از سال ۲۰۱۶ تاکنون در دست «طیفی خاص» بوده است.
کنگره ایرانیان کانادا پیشتر نیز مورد انتقاد شماری از ایرانیان ساکن این کشور قرار گرفته بود.