به گفته یک عضو مجمع تشخیص مصلحت نظام، مخالفت برخی اعضا با نظر حسن روحانی در مورد مسئول تدوین برنامه ششم توسعه، دلیل «قهر» رئیس جمهور و شرکت نکردن او در جلسات این مجمع بوده‌است.
محمود محمدی عراقی، یک عضو مجمع تشخیص مصلحت نظام، روز دوشنبه ۹ آذر به خبرگزاری فارس، دربارهٔ علت غیبت حسن روحانی در جلسات مجمع، گفت که «این مسئله در همین جلسه اخیر از سوی آقای هاشمی [رئیس مجمع تشخیص] هم مطرح شد.»
محمدی عراقی اعلام کرد: «وقتی بحث سیاست‌های برنامه ششم توسعه در مجمع مطرح شد، آقای روحانی معتقد بود که تعیین این سیاست‌ها از وظایف دولت است و نباید مجمع در این مسئله ورود کند اما اکثر اعضای مجمع خواستند که مجمع دربارهٔ این سیاست‌ها ورود پیدا کند، لذا آقای روحانی بعد از آن جلسه دیگر در جلسات مجمع شرکت نکردند.»
آقای محمد عراقی، همچنین در پاسخ به این پرسش که «آیا حسن روحانی به دلیل اعتراض به این روند مجمع از حضور در جلسات امتناع می‌کند»، گفت: «از صحبت‌های آقای هاشمی اینطور استفاده می‌شد، که انگار آقای رئیس‌جمهور وقتی نظر اعضای مجمع این گونه شد، قهر کردند و به مجمع نیامدند.»
این عضو مجمع تشخیص مصلحت نظام، در عین حال به موضع سخنگوی دولت دربارهٔ علت غیبت روحانی اشاره کرد و افزود: «نماینده دولت گفته‌است که این غیبت فقط به خاطر مشغله کاری بوده‌است چراکه ممکن است مجمع چندین ساعت دربارهٔ یک ماده بحث کند؛ بنابراین دلیل‌شان این بود که البته واقعیت این نیست.»
به نوشته خبرگزاری فارس، حسن روحانی برای چندمین بار پیاپی، روز شنبه در جلسه مجمع تشخیص که ۷ آذر به ریاست اکبر هاشمی رفسنجانی برگزار شد، شرکت نکرده‌است.
به گزارش این خبرگزاری، آقای روحانی که به تدوین برنامه ششم توسعه از سوی مجمع تشخیص معترض بوده، تأکید کرده که دولت باید به تدوین این برنامه بپردازد که با مخالفت اکبر هاشمی رفسنجانی و اعضای مجمع مواجه شده و پس از این جلسه دیگر در جلسات مجمع شرکت نکرده‌است.
پیشتر محمود احمدی‌نژاد نیز در زمان ریاست جمهوری خود از شرکت در بیشتر این جلسات امتناع می‌کرد.
آقای احمدی‌نژاد، بعد از سه سال غیبت از اولین جلسه مجمع در فرودین ۸۸، روز اول اردیبهشت سال ۹۲ در جلسه مجمع تشخیص مصلحت نظام شرکت کرد.