علی مطهری، نایب رئیس مجلس شورای اسلامی، روز چهارشنبه پنجم دی توئیت کرد که آیت‌الله علی خامنه‌ای، رهبر ایران، در «نماز میت» بر روی جنازه محمود هاشمی شاهرودی جمله‌ای را بیان کرد که در نماز مشابه برای اکبر هاشمی رفسنجانی از آن دریغ کرده بود.
این دو چهره روسای مجمع تشخیص مصلحت نظام بودند.
آیت‌الله هاشمی شاهرودی روز چهارشنبه در شهر قم به خاک سپرده شد و آیت‌الله خامنه‌ای که نماز میت را برای او به جا آورد جمله «اللهم انّا لانعلم منه الا خیرا» را برای او به کار برد که به معنای «ما به جز خوبی از او نمی‌دانیم».
آقای خامنه‌ای اما دو سال قبل هنگام خاکسپاری آیت‌الله هاشمی رفسنجانی، نخستین رئیس مجمع تشخیص مصلحت نظام، جمله فوق را که به طور معمول در نماز میت به کار برده می‌شود، نخواند و به جای آن سه بار جمله «اللهم عفوک عفوک عفوک» را خواند که از خداوند درخواست بخشش برای فرد درگذشته می‌کند.
علی مطهری با مقایسه این رفتار دوگانه در توئیتر نوشت: «به نظر می‌رسد علت آن نوع برخوردی است» که آقای هاشمی رفسنجانی و آقای هاشمی شاهرودی «درباره معترضان انتخابات سال ۸۸ داشتند».
اکبر هاشمی رفسنجانی در انتخابات ریاست‌جمهوری سال ۱۳۸۸ از میرحسین موسوی حمایت کرد، چهره‌ای که مدعی تقلب گسترده و سازماندهی‌شده در انتخابات شد و درخواست ابطال این انتخابات را مطرح کرد. این امر اعتراضات گسترده‌ای را در کشور به دنبال داشت تا جایی که سه روز بعد از انتخابات، صدها هزار نفر از حامیان آقای موسوی خیابان‌های انقلاب و آزادی را تصرف کردند.
با این حال علی خامنه‌ای در نماز جمعه هفته بعد از انتخابات، نتیجه آن را تایید کرد و جانب محمود احمدی‌نژاد را گرفت که مدعی پیروزی در این انتخابات شده بود. وی همچنین در آن نماز جمعه اعلام کرد که نظراتش به آقای احمدی‌نژاد نزدیک‌تر است تا آقای هاشمی رفسنجانی که برای هشت سال رئیس‌جمهور بود.
اما در نقطه مقابل، محمود هاشمی شاهرودی آن زمان ریاست قوه قضاییه را برعهده داشت، مجموعه‌ای که احکام سنگینی را علیه معترضان و حامیان میرحسین موسوی و مهدی کروبی صادر کرد. دادگاه بسیاری از چهره‌های سرشناس جناح موسوم به اصلاح‌طلب، روزنامه‌نگاران و فعالان مدنی از تلویزیون نیز پخش شد.
آقای خامنه‌ای در پیام تسلیت خود به مناسبت درگذشت هاشمی شاهرودی از او به عنوان «کارگزاری باوفا در مهم‌ترین تشکیلات جمهوری اسلامی» نام برد.
برخورد متفاوت آقای خامنه‌ای در نمازهای میت برای هاشمی رفسنجانی و هاشمی شاهرودی همچنین واکنش کاربران در شبکه‌های اجتماعی نظیر توئیتر را به دنبال داشت که از آن به عنوان «تفاوت‌های هاشمی‌ها» یاد کردند.
کاربری نوشت: «تعداد دفعات قرائت"اللهم انالانعلم منه الاخیرا" توسط رهبری برای مهدوی کنی۳، رفسنجانی ۰، شاهرودی ۱. برای رفسنجانی ۹ بار "عفوک" قرائت شد. فتامل».
و کاربر دیگری هم به اسم تایگر الون نوشت: «عده‌ای میگن چقدر فرق هست میان هاشمی رفسنجانی با هاشمی شاهرودی. می‌پرسی چه فرقی؟ میگن حضرت آقا برا رفسنجانی سه بار گفت عفوک و نگفت لانعلم الا خیرا، اما واسه شاهرودی عفوک نگفت و دومی را گفت. انگار ملاک خدا اینه که این ... واسه کی میگه عفوک واسی کی میگه لانعلم الا خیرا».