پس از انتقادهای اصول‌گرایان به بحث همه‌پرسی، اکنون نوبت به اصلاح‌طلبان رسیده‌است. عمار ملکی استادیار علوم سیاسی در هلند می‌گوید ورود اصلاح‌طلبان به این بحث برای‌شان خطرناک است. نعمت احمدی حقوقدان در تهران هم براین باور است که در اصل ۵۹ جایی برای شورای نگهبان در نظر گرفته نشده‌است.