مهدی کروبی از حصر خانگی در نامه‌ای خطاب به محمد یزدی از وجود «قرارگاه‌هایی برای خواسته‌های فراقانونی مراکز قدرت» در کشور سخن به میان آورده و آیت‌الله یزدی را «یکی از فعال‌ترین افراد این مراکز» معرفی کرد. آقای کروبی نوشت: «این قرارگاه‌ها معمولا پیش از اجرای عملیات‌شان اقدام به ریختن آتش تهیه می‌کنند تا به زعم باطل خود زمینه را برای هجوم پیاده نظام‌شان فراهم سازند.» نامه مهدی کروبی در واکنش به نامه انتقادی محمد یزدی به آیت الله موسی شبیری زنجانی به خاطر دیدار با محمد خاتمی و شماری از چهره‌های اصلاح‌طلب نوشته شده است. آقای یزدی در آن نامه از این مرجع تقلید خواسته بود «شان مرجعیت را رعایت» کند. درباره نامه مهدی کروبی به محمد یزدی، دیدگاه محمدجواداکبرین دین‌پژوه و تحلیل‌گر مسائل سیاسی در پاریس را جویا شده‌ایم.