استاندار فارس اعلام کرد که در لحظات پایانی روز شنبه ۲۳ اسفند، «عوامل اصلی» حمله به علی مطهری، نماینده مجلس، شناسایی و به مقامات قضایی استان معرفی شدند.
محمد احمدی در مورد «عوامل اصلی» این حمله توضیح بیشتری ارائه نداد اما به گزارش خبرگزاری ایسنا وعده داد که «شناسایی سایر عوامل و زمینه‌سازان انجام این حرکت ناپسند و هنجارشکنانه در دست بررسی و اقدام لازم قرار دارد.»
آقای احمدی همچنین افزود که شناسایی عوامل این حمله در پی «دستور اکید» رئیس جمهور و «تأکید مکرر» وزیر کشور مبنی بر «شناسایی دقیق و برخورد قاطع با حمله‌کنندگان به خودروی علی مطهری» انجام شده‌است.
حسن روحانی، رئیس جمهوری ایران، در نامه‌ای به وزرای اطلاعات و کشور دستور داده‌است مسئله حمله به علی مطهری در شیراز پیگیری شود.
در همین حال محمدرضا صادق، مشاور رسانه‌ای حسن روحانی روز جمعه گفته‌بود که اگر استاندار فارس نتواند با خاطیان اتفاقات شیراز و حمله به علی مطهری برخورد کند باید از سمت خود استعفاء دهد.
علی مطهری، نماینده تهران در مجلس، که روز ۱۸ اسفند برای سخنرانی در دانشگاه شیراز به این شهر سفر کرده بود در فرودگاه این شهر «با هجوم نیروهای لباس‌شخصی مورد ضرب‌وشتم» قرار گرفت و در نهایت مجبور به بازگشت به تهران شد.
آقای مطهری روز شنبه، ۲۳ اسفند و پس از سخنان امام جمعه شیراز در نماز جمعه، او را متهم ردیف اول در حمله به خود معرفی کرد.
اسدالله ایمانی، امام جمعه شیراز روز جمعه ۲۲ اسفندماه، در سخنانی تلویحاً علی مطهری را به «طاغوت» و «فتنه» منتسب دانسته و گفته بود «اگر کسی حریم ولایت و خبرگان و فتنه را شکست، باید انتظار داشته باشد که دیگران حریم او را نشکنند؟»
امام جمعه شیراز روز شنبه پس از تکرار سخنان گذشته خود درباره آقای مطهری گفت: «وقتی یک نماینده در مجلس در حین صحبت به دلیل اخطار همکاران خود با مشت برخورد می‌کند باید انتظار داشته باشد که در اجتماع نیز عده‌ای با او با مشت برخورد کنند و مصداق این ضرب المثل است: اگر باد بکارید طوفان درو می‌کنید.»
به گزارش وب‌سایت عصر ایران، آقای ایمانی با بیان اینکه نامه آقای مطهری در «شأن جواب و پاسخ دادن» نیست افزود: «این آقا به دلیل عدم جواب منطقی از ادبیات فحش، زشت و مستهجن استفاده می‌کند.»
وی تصریح کرد: «ظلم بزرگی به استان فارس می‌شود و به ناحق شرایط استان فارس را می‌شکنند و این درحالی است که در استان‌های دیگر حوادث بدتر و بیشتری رخ داده‌است اما این طور بزرگ‌نمایی نشد.»
درهمین حال در روزهای گذشته سخنان متفاوتی درباره عوامل حمله به آقای مطهری از سوی چهره‌های سیاسی اصول‌گرا مطرح شده‌است.
حمید رسایی، از نمایندگان عضو جبهه پایداری در مجلس گفته‌است: «اتفاقی که در شیراز رخ داده کار بچه حزب‌اللهی‌ها نیست و اگر کسی که این کار را کرده چنین ادعایی دارد، مثل آنهایی که از اعتدال دم می‌زنند، دروغ می‌گوید.»
این درحالی است که به گزارش خبرآنلاین محی‌الدین حائری شیرازی، عضو مجلس خبرگان رهبری و امام جمعه سابق شیراز گفته‌است که عوامل حمله به آقای مطهری «اراذل و اوباش نبود[ند]، جوان نمازخوان ولایتی جان‌برکف برای اسلام بودند.»
علی مطهری، روز سه‌شنبه ۱۹ اسفند درباره حمله‌کنندگان به خود گفته بود: «ظاهراً یک اصل پذیرفته شده بود؛ این افراد که از تجهیزات‌شان مانند موتورهای سنگین و گاز فلفل معلوم بود از کجا دستور گرفته‌اند.»
«موتورهای سنگین» معمولاً توسط نهادهای نظامی و نیروهای بسیج در ایران استفاده می‌شود.
گفته‌های آقای مطهری درحالی است که غلامحسین غیب‌پرور، فرمانده سپاه فارس، در این باره گفته‌است: «ما با اینگونه برخوردهای سخیف مثل سنگ‌پراکنی مخالفیم و شدیداً محکوم می‌کنیم.»
در روزهای گذشته همچنین برخی از نمایندگان مجلس حمله به آقای مطهری را محکوم کرده‌اند.
علی لاریجانی، رئیس مجلس ایران نیز در جلسه علنی روز یکشنبه مجلس از وزارت کشور و وزارت اطلاعات خواست که با مسئله حمله به آقای مطهری «برخورد جدی» کنند.
وی اضافه کرد: «افرادی که به این امور می‌پردازند توجه کنند اقدامات آنان نه توجیه دینی دارد نه توجیه انقلابی و نه توجیه قانونی.»
پیش از این نیز درخواست آقای مطهری برای رفع حصر میرحسین موسوی و مهدی کروبی، دو نامزد معترض به نتیجه انتخابات ریاست جمهوری سال ۸۸، بارها اعتراض حامیان آیت‌الله علی خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی ایران، را سبب شده‌است.
از جمله روز ۲۱ دی، «حمله» برخی از نمایندگان مجلس به علی مطهری، نماینده تهران، و درگیری فیزیکی پس از درخواست دوباره او برای رفع حصر میرحسین موسوی و کروبی در نطق میان‌دستور، باعث تعطیلی موقت جلسه علنی مجلس شد.
